La museografía del Museo Ayoreo fue renovada en el 2018 tras 10 años de que la colección permaneciera guardada en un depósito.

Esta colección de objetos Ayoreo ha sido conformada por el Sacerdote Salesiano Doctor José Zanardini, antropólogo que vivió muchos años con las aldeas indí­genas del Chaco.
La colecta de objetos la inició desde 1978 conjuntamente con los miembros de la comunidad. Los objetos provienen de Puerto María Auxiliadora, Bolivia, Chaco Central e incluyen objetos de grupos silví­colas contactados en 1987 y en 1999.

El Museo fue Inaugurado por primera vez en 1996 por el Centenario de la llegada de Los Salesianos al Paraguay.

Fotografías: Archivo personal Alejandra Peña Gill / Centro de Estudios Arqueológicos e Históricos del Paraguay